Kineski istraživači razvili opsežan integrisani transkriptomski atlas za soju

Kineski istraživači konstruisali su sveobuhvatan integrisani transkriptomski atlas za soju, prvu prostorno-vremensku mapu razvoja organa tokom celokupnog životnog ciklusa domaće soje, saopštila je Kineska akademija nauka (CAS), prenosi Sinhua.

Molekularni dizajn oplemenjivanja može efikasno ubrzati proces uzgoja soje. Međutim, složeni mehanizmi razvoja organa kod soje dugo su predstavljali izazov za naučnike koji nastoje da ih detaljno prouče.

Posmatrajući svaki organ soje kao precizno podešenu „fabriku“, geni funkcionišu poput „radnika“ na proizvodnim linijama, dok transkriptomski atlas služi kao nadzorni sistem fabrike.

U prethodnim istraživanjima, naučnici su uglavnom mogli da posmatraju samo celokupni rezultat ove .“fabrike.“. Međutim, nova tehnologija im sada omogućava da prate stanje svakog „radnika“.

Na osnovu podataka iz RNA sekvenciranja dobijenih iz 314 uzoraka celih organa, istraživači sa Kineske akademije nauka i Kineskog društva za biljnu biologiju precizno su identifikovali razvojne faze organa i karakteristične gene ključnih organa.

Nakon toga, pomoću sekvenciranja pojedinačnih jedara ćelija uspeli su da mapiraju ćelijsku ekspresiju pet glavnih funkcionalnih organa: korena, kvržica korena, vršnog izdanka, listova i stabla.

Integracijom multidimenzionalnih tehnologija postigli su trodimenzionalnu vizualizaciju ekspresije gena u organima soje – što su istraživači nazvali „mapom“ za soju.

Razjašnjavanje genetskih regulatornih mreža koje upravljaju razvojem organa soje ključno je za uzgoj superiornih i otpornijih sorti, kako bi se osiguralo povećanje proizvodnje soje u uslovima promenljivih klimatskih faktora, navodi se u istraživanju objavljenom u časopisu Molekular plant (Molecular Plant).

Integrisani transkriptomski atlas, koji kombinuje različite vrste transkriptomskih podataka, može olakšati karakterizaciju prostorno-vremenskih obrazaca ekspresije gena povezanih s razvojem organa i time pomoći istraživačima da bolje razumeju procese razvoja biljnih organa, istaknuto je u radu.

(Beta)

Pratite Krstaricu na www.krstarica.com